string strAppPoolName = "MyAppPool1";
System.DirectoryServices.DirectoryEntry appPoolRoot = new System.DirectoryServices.DirectoryEntry(@"IIS://localhost/W3SVC/AppPools");
System.DirectoryServices.DirectoryEntry newAppPool = appPoolRoot.Children.Add(strAppPoolName, "IIsApplicationPool");
//如果指定标识，可以使用下面的方法，否则，可以直接执行 CommitChanges 方法：
// 0 = Local System（本地系统）
// 1 = Local Service（本地服务）
// 2 = Network Service（网络服务）
// 3 = Custom Identity（自定义配置）需要设置 WAMUserName 和 WAMUserPass 属性

newAppPool.Properties["AppPoolIdentityType"][0] = 3;
newAppPool.Properties["WAMUserName"][0] = @"VISTA\1"; //domain\用户，注意：此用户必须在IIS_WPG组中
newAppPool.Properties["WAMUserPass"][0] = "1";
//其它属性类似，如设置Web园数目：
newAppPool.Properties["MaxProcesses"][0] = 5;//不明白：请大神给解读一下
newAppPool.CommitChanges();