我源码安装effectorsearch 和MCScanX这2个软件,遇到同一类问题
安装effectorsearch之前需激活local blast、glimmer、hmmer, 附带手册里都是源码安装,我试过源码安装会报错,缺少库文件,我后来发现这三个软件均能通过miniconda 安装,安装在 conda下,我是小白,没学过计算机,我理解的是 conda帮忙解决了环境,这软件conda下估计能用,但我回头编译effectorsearch(在另外目录下)的时候,怎么激活呢?
比如:我的effectorsearch的pwd:/home/fanchen/newbiosoft/effectorsearch/Effectorsearch
我的那三个软件bin在:/root/miniconda3/pkgs/glimmer-3.02-3/bin
是不是 vim ~/.brashrc
export PATH=$PATH:/root/miniconda3/pkgs/glimmer-3.02-3/bin
然后 source ~/.brashrc
然后cd /home/fanchen/newbiosoft/effectorsearch/Effectorsearch
再编译安装嘛?
小白,希望大神指点迷津
高!