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linux源码安装effectorsearch或MCScanX, 如何激活环境

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悬赏园豆:10 [已解决问题] 解决于 2021-06-04 16:31

我源码安装effectorsearch 和MCScanX这2个软件,遇到同一类问题

安装effectorsearch之前需激活local blast、glimmer、hmmer, 附带手册里都是源码安装,我试过源码安装会报错,缺少库文件,我后来发现这三个软件均能通过miniconda 安装,安装在 conda下,我是小白,没学过计算机,我理解的是 conda帮忙解决了环境,这软件conda下估计能用,但我回头编译effectorsearch(在另外目录下)的时候,怎么激活呢?

比如:我的effectorsearch的pwd:/home/fanchen/newbiosoft/effectorsearch/Effectorsearch
我的那三个软件bin在:/root/miniconda3/pkgs/glimmer-3.02-3/bin
是不是 vim ~/.brashrc
export PATH=$PATH:/root/miniconda3/pkgs/glimmer-3.02-3/bin
然后 source ~/.brashrc
然后cd /home/fanchen/newbiosoft/effectorsearch/Effectorsearch
再编译安装嘛?

小白,希望大神指点迷津

凡尘26222的主页 凡尘26222 | 初学一级 | 园豆:6
提问于:2020-04-17 22:46
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高!

收获园豆:10
小白丸子 | 菜鸟二级 |园豆:212 | 2020-04-18 08:32
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