Amber中，Restart与Restart不符

[待解决问题]

$ ambpdb -p 4udc-dexsol.prmtop < npt20.restrt7 > 1npt20.pdb
Error: Number of atoms in Amber Restart STDIN (28) does not
match number in associated parmtop (29852)
这该怎么解决，Amber Restart STDIN (28)， associated Restart (29852)，这里的数字是什么

amber

biyebiyebiye | 菜鸟二级 | 园豆：202
提问于：2023-03-05 20:33

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所有回答(1)

查看一下PDB的起始原子序号，可能是不一致导致的

Sunny-King | 园豆：363 (菜鸟二级) | 2023-03-06 15:26

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Amber中，Restart与Restart不符

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